eKera http://www.ekera.fr/ Espace de travail cybernétique pour les membres du ConsortiHom. <form action="http://www.ekera.fr/search.php" method="GET"><input type="text" name="search" size="10" value="Chercher..." maxlength="128" /><input type="submit" value="»" /></form> fr 2005-2009, eKera contact@ekera.fr contact@ekera.fr Mon, 21 May 2012 03:37:46 GMT Yet Another Community System http://blogs.law.harvard.edu/tech/rss 70 Cadre général et enjeux de la thèse http://www.ekera.fr/articles/view.php/657 http://www.ekera.fr/articles/view.php/657 II.1. Enjeux scientifiques, techniques, et économiques Les nanotechnologies en général constituent aujourd’hui un des axes prioritaires de recherche en France et de par le monde. Il s’agit en effet de répondre aux nouveaux défis que pose la réduction de taille des composants, circuits et systèmes à des échelles qui côtoient le nanomètre. Pour fixer les idées, un nanomètre (nm) correspond à un milliardième de mètre (50000 fois plus fin qu’un cheveu), alors qu’un atome est de l’ordre de 1 à quelques nanomètres et un virus mesure entre 10 et 100 nm (Fig.1) ... page principale II.1. Enjeux scientifiques, techniques, et économiques

Les nanotechnologies en général constituent aujourd’hui un des axes prioritaires de recherche en France et de par le monde. Il s’agit en effet de répondre aux nouveaux défis que pose la réduction de taille des composants, circuits et systèmes à des échelles qui côtoient le nanomètre. Pour fixer les idées, un nanomètre (nm) correspond à un milliardième de mètre (50000 fois plus fin qu’un cheveu), alors qu’un atome est de l’ordre de 1 à quelques nanomètres et un virus mesure entre 10 et 100 nm (Fig.1).

Figure 1 : Ordres de grandeurs de certains objets physiques.

Les nanostructures magnétiques en particulier sont extrêmement actives car il s’agit d’un domaine hautement stratégique à très fort enjeu économique et au potentiel de développement très important [1]. L’augmentation des performances des appareils électroniques, expliquant pour une bonne part l’essor exceptionnel, ces quinze dernières années, des technologies de l’information et de la communication, est liée en premier lieu à la miniaturisation croissante des composants électroniques (transistor, capteurs, mémoire magnétique) (loi de Moore : « la densité d’informations contenue dans une puce double tous les 18 mois »). Cette course à la miniaturisation et à la densification de l’information suppose aussi un croisement fertile entre des disciplines scientifiques très diverses que l’on regroupe sous le vocable de « nanosciences ». Pour faire face aux défis ainsi posés à la recherche scientifique, la France se dote aujourd’hui d’un réseau de grandes centrales de micro-nanotechnologie, encore appelé réseau technologique de base (RTB). Plus, des réseaux de recherche et d’innovation technologiques (RIT), créés il y a quelques années et amenés à évoluer prochainement, permettent de favoriser la collaboration entre recherche publique et industrielle. Citons par exemple le Réseau micro- et nanotechnologies (RMNT), le Réseau national matériaux et procédés (RNMP) et le Réseau national de recherche en télécommunications (RNRT). [1] : Nanosciences, nanotechnologies. Rapport de l’Académie des sciences et de l’Académie des technologies éditions Tech & Doc (2004).

II-2 Ma thèse dans son contexte Ma thèse porte sur l’étude dynamique de renversement de l’aimantation dans les nanofils ferromagnétique. L’objectif visé est d’étudier la dynamique de spins et les phénomènes linéaires et non linéaires de renversement de l’aimantation dans les nano-objets structurés (en particulier dans les nanofils magnétiques). Ces types de structures sont particulièrement intéressants pour des études fondamentales dans les différents domaines de sciences nanométriques appliqués telles que le transport électronique direct (GMR : magnétorésistance géant) ou par injection du courant polarisé en spin et le renversement de l’aimantation. L’étude concerne principalement les nanofils constitués des structures en multicouche de Ni, Co et Co/Cu (diamètre des nanofils entre 15 nm et 100 nm), élaborés par la technique d’électrodéposition.

Pourquoi les nanofils ?

Un nanofils a un intérêt fondamental du fait que c’est un système unidimensionnel. Cet intérêt vient du fait qu’on diminue le nombre de degré de liberté dans le système étudié. En même temps, il représente, un système d’étude qui peut nous offrir une meilleure compréhension des phénomènes physique qui apparaisse dans des systèmes de taille réduit. C.à.d en diminuant la taille de l’échantillon jusqu’à la taille nanométrique, on intensifie les propriétés physiques.

Ce quoi les nanofils ?

Les nanofils sont des fils pleins de diamètre de l’ordre de 10-9 m et de longueur de quelque micromètre.il peuvent être fabriqué par divers matériaux comme les métaux magnétiques, semi-conducteur, isolant…. Ils constituent un exemple de structures magnétiques très important de par leur géométrie qui se trouve à l'origine de propriétés intéressantes autant du point de vue magnétique que celui du transport électronique. Ils peuvent se trouver des applications dans la nouvelle génération de mémoires magnétiques (MRAM (Magnetic Random Access Memory) qui a l’avantage considérable par rapport aux RAM traditionnelles d’être non volatiles) ou dans les nouveaux types de capteurs magnétiques (qui détectent les champs magnétiques), les dispositifs de transport et de traitement de l’information, l’électronique de spin pour le stockage de l’information et les têtes de lecture ainsi que dans les dispositifs optoélectroniques (écrans, afficheurs à cristaux liquides). La fabrication de nos échantillons a été la principale activité lors de la première année de la thèse. L’élaboration de ces nanofils pourrait être faire par plusieurs méthodes, une meilleurs parmi ses méthodes est l’électrodéposition électrochimique, qui est une méthode accessible est avantageuse.

Ce quoi la technique d’électrodéposition ?

La technique d’électrodéposition est un processus d’oxydoréduction qui permet de déposer un métal sur une surface conductrice à partir d’une solution contenant les ions du métal à déposer par le passage d’un courant électrique. Les nanofils étudiés sont obtenus par une méthode d’électrodéposition dans des membranes poreuses (polycarbonate, alumine) soit commerciales soit fabriquées localement. Les nanofils élaborés sont caractérisés structurellement et magnétiquement à l’aide des méthodes suivantes : VSM, FMR, MFM, AFM et TEM.

La phase finale du projet porte sur l’analyse et la synthèse des résultats obtenus, en particulier sous l’angle de la potentialité d’application en nanotechnologies (composants optoélectroniques, enregistrement magnétique de grande densité, biotechnologies). ghaddar Ghaddar Abbas Mon, 23 Jun 2008 07:32:07 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/657#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/657 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/657 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:657 Compétence, savoir-faire, qualités professionnelles et personnelles http://www.ekera.fr/articles/view.php/658 http://www.ekera.fr/articles/view.php/658 IV- Compétence, savoir-faire, qualités professionnelles et personnelles IV-1 Compétences techniques et scientifiques ... page principale IV- Compétence, savoir-faire, qualités professionnelles et personnelles

IV-1 Compétences techniques et scientifiques

Je mettrai en avant mes compétences dans le domaine de nanotechnologie. En effet, grâce à mes expériences passées au LPM (Laboratoire de Physique des Matériaux) à la faculté des sciences au Liban, à l’IPCMS (Institut de Physique et Chimie des Matériaux de Strasbourg) et actuellement au LMB (Laboratoire de Magnétisme de Bretagne, Brest) et au LCEMCA (Laboratoire de Chimie, Électrochimie Moléculaire et Chimie Analytique, Brest), j’ai abordé les principaux aspects de la physique du magnétisme dans les nano-structures en général et la fabrication, les études électronique, magnétique et structurale des nano-fils ferromagnétiques en particulier. En outre, les TD et les TP que j’ai dispensés à l’université de Bretagne Occidentale ont été également une expérience forte enrichissante.

IV-1.1 Connaissances acquises :

Dans ces dernières années, je dirais que mon parcours universitaire de la Licence jusqu’au doctorat, sont inscrit précisément dans le domaine de physique et chimie des matériaux magnétiques et des nano-structures et à couvert de nombreux aspects théoriques et expérimentaux. Ce parcours m’apparaît rétrospectivement comme ayant été initialement dicté par mes goûts personnels pour les Sciences et la physique des matériaux et toujours enrichi par mes rencontres au sein des milieux universitaire et de la recherche. Mes nombreuses communications lors de congrès nationaux et internationaux ont de même contribué fortement à cet enrichissement personnel.

Mes thèmes de recherche principaux sont :

  • Physique du solide, magnétisme, transport électrique.
  • Caractérisations structurale et magnétique (XRD, VSM, MEB, AFM, MET)
  • Effet magnéto résistif.
  • Caractérisation par résonance ferromagnétique.
  • Élaboration des nanofils et des couches minces par voie électrochimique.
  • Élaboration des couches minces par technique de vide.
  • Technique de vide par pulvérisation cathodique et par évaporateur thermique.


Thèmes de recherche visée (après la thèse)

• Je souhaiterais m’investir dans des projets performants et innovants d’une entreprise (laboratoire) en Recherche et Développement. • Élargissement de ma thématique vers d’autres applications de la nanotechnologie.

IV-2 Compétences méthodologique en communication et conduite de projet

Méthodologie de communication :

La communication des résultats scientifique est essentielle dans la recherche. Elle peut être publiée par deux manières.  Communications écrites :

 Rédaction des articles scientifiques dont il est nécessaire de bien faire l’analyse et le choix du support, respecter les créneaux de diffusion et faire la rédaction au format demandée qui me sert de présenter mon travail d’une manière professionnel.  Faire écrire et tourner la lettre de motivation et le cv d’une manière à s’aboutir au profil de travail ou de post doc cherché.

 Communications orales :

 Conférences : ces présentations (à Rennes, Lyon, Nantes (national) Tokyo (international)) d’une durée de 20 minutes ont permis à la fois une vulgarisation de mes recherches et une illustration sonore et visuelle des concepts exposés dans l’article des Actes de la conférence.  Séminaires : présentation des travaux dans des groupes de travail (École polytechnique à Paris, ULP à Strasbourg, IFPAN à Varsovie en Pologne et dans notre laboratoire devant les différentes groupe du laboratoire) pour montrer l’avancement de travail, pour trouver les point faible et fort dans le projet en discutant avec les spécialiste dans le domaine et à la fin par exemple pour faire des collaborations avec des autres laboratoires.

IV-4 Savoir faire administratifs, organisationnels et linguistiques

 J’ai développé des savoirs faires administratifs :

o demande de subvention pour les missions, auprès de la région de Bretagne o gestion du transport et du logement pour mes missions.

 Mes savoir faire organisationnels proviennent de la gestion simultanée de plusieurs projets : o sujets de recherche ; o rédaction d’articles ; o préparation et réalisation d’enseignement ; o encadrement de stagiaires.

Mes langues de travail sont le français, l’anglais, et l’arabe. ghaddar Ghaddar Abbas Mon, 23 Jun 2008 07:31:26 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/658#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/658 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/658 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:658 Liens Utiles http://www.ekera.fr/articles/view.php/651 http://www.ekera.fr/articles/view.php/651 Redactionnel Redactionnel lucrecius Outils Tue, 29 Apr 2008 03:51:24 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/651#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/651 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/651 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:651 Liens France-Culture http://www.ekera.fr/articles/view.php/648 http://www.ekera.fr/articles/view.php/648 Pour réutilisation ultérieure (chargements/enregistrements)
Pour réutilisation ultérieure (chargements/enregistrements)
lucrecius Tests Divers Mon, 06 Aug 2007 08:42:16 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/648#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/648 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/648 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:648 Poitou-Charentes (86021) http://www.ekera.fr/articles/view.php/647 http://www.ekera.fr/articles/view.php/647 Assistance à la mise en oeuvre du Budget Participatif des Lycées de la Région Poitou-Charentes ... page principale
Assistance à la mise en oeuvre du Budget Participatif des Lycées de la Région Poitou-Charentes
Conseil Régional Poitou-Charentes (86021)

Assistance à la mise en oeuvre du Budget Participatif des Lycées de la Région Poitou-Charentes

DétailS lucrecius Veille Sat, 04 Aug 2007 11:11:45 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/647#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/647 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/647 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:647 Edouard G. http://www.ekera.fr/articles/view.php/642 http://www.ekera.fr/articles/view.php/642 GENDREAU Edouard Dossier initié par PierOl  Projet de dessinateur caricaturiste  Fils du Dr Geandreau  Vu par POW , avec sa mère ... page principale GENDREAU Edouard

Dossier initié par PierOl

 Projet de dessinateur caricaturiste
 Fils du Dr Geandreau
 Vu par POW , avec sa mère. lucrecius Dossier Clients Tue, 06 Nov 2007 08:16:40 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/642#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/642 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/642 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:642 Amie d'Y http://www.ekera.fr/articles/view.php/638 http://www.ekera.fr/articles/view.php/638 Ile de Ré  Prise en charge initiale par POW Ile de Ré

 Prise en charge initiale par POW lucrecius Dossier Clients Thu, 19 Jul 2007 19:52:06 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/638#comments 3 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/638 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/638 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:638 NCT Juillet http://www.ekera.fr/articles/view.php/629 http://www.ekera.fr/articles/view.php/629 Piste finale pour le document
Piste finale pour le document
...ne pas oublier d'ajouter le Diaporama. lucrecius Les contributions pour la réalisation du document NCT. Tue, 10 Jul 2007 07:54:20 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/629#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/629 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/629 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:629 Rapport v3.2 http://www.ekera.fr/articles/view.php/628 http://www.ekera.fr/articles/view.php/628 Avec mes propositions de mise en page
Avec mes propositions de mise en page.
Le même document est en trois formats différents dans un seul zip lucrecius Travaux document NCT Fri, 06 Jul 2007 08:18:26 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/628#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/628 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/628 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:628 Travaux budget http://www.ekera.fr/articles/view.php/626 http://www.ekera.fr/articles/view.php/626 lucrecius Document NCT... en cours Wed, 27 Jun 2007 12:54:48 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/626#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/626 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/626 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:626 Commentaires sur le document du 21/06/2007 http://www.ekera.fr/articles/view.php/625 http://www.ekera.fr/articles/view.php/625 lucrecius Les contributions pour la réalisation du document NCT. Wed, 27 Jun 2007 12:35:08 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/625#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/625 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/625 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:625 Présentations du 22 Juin 2007 http://www.ekera.fr/articles/view.php/624 http://www.ekera.fr/articles/view.php/624 Tous les diaporamas qui ont été faits... dans l'état
Tous les diaporamas qui ont été faits... dans l'état.
lucrecius La Présentation Orale Mon, 10 Aug 2009 19:55:39 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/624#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/624 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/624 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:624 Oral 20/06/07 http://www.ekera.fr/articles/view.php/621 http://www.ekera.fr/articles/view.php/621 marie Travaux document NCT Tue, 10 Jul 2007 10:08:12 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/621#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/621 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/621 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:621 Rapport 20/06/07 http://www.ekera.fr/articles/view.php/619 http://www.ekera.fr/articles/view.php/619 marie Travaux document NCT Tue, 10 Jul 2007 10:07:00 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/619#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/619 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/619 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:619 Lots du 19 juin...; et suivants http://www.ekera.fr/articles/view.php/618 http://www.ekera.fr/articles/view.php/618 lucrecius Les contributions pour la réalisation du document NCT. Thu, 12 Jul 2007 06:23:47 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/618#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/618 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/618 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:618 Mon modele de presentation http://www.ekera.fr/articles/view.php/617 http://www.ekera.fr/articles/view.php/617 frise sympa avec chromosomes frise sympa avec chromosomes youna Document NCT... en cours Mon, 18 Jun 2007 13:13:30 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/617#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/617 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/617 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:617 Diagramme de GANTT avec modifications (couleurs) http://www.ekera.fr/articles/view.php/616 http://www.ekera.fr/articles/view.php/616 lucrecius Travaux sur le document NCT Mon, 18 Jun 2007 12:32:22 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/616#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/616 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/616 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:616 Modèle de présentation orale. http://www.ekera.fr/articles/view.php/615 http://www.ekera.fr/articles/view.php/615 Trame à respecter pour la présentation orale
Trame à respecter pour la présentation orale
Le même modèle en trois versions :
 MS-Power-point
 OpenOffice
 PdF lucrecius Informations Utiles & Liens Mon, 18 Jun 2007 11:35:15 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/615#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/615 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/615 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:615 NCT 060717 Revu par Mentor http://www.ekera.fr/articles/view.php/614 http://www.ekera.fr/articles/view.php/614 Pour mémoire (et suite) .... le document tel que nous l'avons revu ce lundi 18 matin ... page principale Pour mémoire (et suite) .... le document tel que nous l'avons revu ce lundi 18 matin. lucrecius Document NCT Mon, 18 Jun 2007 08:48:43 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/614#comments 0 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/614 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/614 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:614 NCT http://www.ekera.fr/articles/view.php/610 http://www.ekera.fr/articles/view.php/610 Version 070617
Version 070617

I. Cadre général et enjeux de la thèse

1. Présentation succincte de la thèse et de ses enjeux

L’huître creuse japonaise est une espèce introduite en France depuis les années 1970, afin de sauver l’ostréiculture après la diminution des stocks de l’huître portugaise causée par des maladies. Sa résistance aux variations environnementales, mais aussi aux polluants a fait d’elle une espèce invasive sur nos côtes. Sa propagation est massive depuis les années 1990, période à partir de laquelle une augmentation de la température de l’eau peut être observée. Cependant ce phénomène peut être associé à des processus biologiques adaptatifs. Le but de cette étude est de mieux comprendre les mécanismes biologiques qui ont permis une telle adaptation dans un environnement a priori défavorable. Pour se faire, des populations d’huîtres vivant à la limite de l’aire de répartition de l’espèce ont été étudiées durant un cycle de gamétogénèse afin de mettre en évidence des différences de croissance, de potentiel reproducteur, de résistance, mais aussi des différences génétiques.
Cette étude s’intègre dans le programme PROGIG (Prolifération C. gigas) financé de 2005 à 2008 qui vise à estimer les conséquences éthologiques, économiques et biologiques de la prolifération de C. gigas en Bretagne. Ce programme a pour but de proposer des mesures de gestion/restauration adaptées aux problèmes spécifiques (substrats, usages, impacts de la restauration…) et, à partir d’une approche méthodologique d’analyse de risque, d’évaluer de façon prospective le devenir de cette expansion (dynamisme). L’équipe scientifique permettant de répondre à cette problématique est constituée par un ensemble de 37 chercheurs, enseignants-chercheurs et techniciens issus de différents organismes de recherche (Université –Ifremer – CNRS) et de différentes disciplines Ecologie et Biologie Marine, Génétique, Socio-Economie, Ethnologie, Géographie-Géomatique, Géomorphologie de laboratoires répartis sur les côtes Manche-Ouest et façade Atlantique entre La Baie du Mont St Michel au Nord et le Bassin d’Arcachon au Sud. L’organisation est dirigée par un groupe de pilotage et de coordination qui collabore avec des acteurs locaux sur différents sites : cellule Contrat de Baie Rade de Brest, Chargés de missions Natura (Trégor-Goelo, Golfe du Morbihan, Diren Bretagne, Services Régionaux de l’Environnement…). Lors de sa mise en place cette étude ne visait qu’à l’étude de l’invasion en Bretagne, mais pourrait déboucher après 2008 sur une demande de financement européen afin de suivre l’invasion de l’huître du Pacifique sur une plus large zone géographique pour mieux en estimer les impacts.

2. Implication dans le sujet et contexte de la thèse

Mes stages antérieurs ont fait naître en moi une réelle passion pour la génétique et la physiologie appliquée à l’environnement. C‘est ainsi que j’ai été retenue pour effectuer 5 mois de formation au Laboratoire des Sciences de l’Environnement MARin (LEMAR) dans le cadre de mon DEA (ancien nom du diplômebac+5 Master 2) pour travailler sur les réponses au stress de l’huître creuse et du flet Platichthys flesus. Durant cette période de nombreuses observations de prolifération de l’huître en Rade de Brest ont été effectuées. Puisqu’il était encore difficile de déterminer avec certitude que cette espèce était invasive, ce qui a été vérifié depuis, Marie-Thérèse Thébault, ma responsable de stage, Christian Hily et moi-même nous sommes demandés quel pouvait être le potentiel invasif de cette espèce. Nous avons tous les trois fixé les grandes lignes des études qui pourraient être menées pour répondre à cette question. C’est ainsi que mon travail de thèse a débuté en octobre 2004 au LEMAR. Ce sujet s’intégrait parfaitement dans l’équipe « Biologie des interactions et des adaptations », mais requérait des informations écologiques abordées dans le cadre de l’équipe « Réponse des écosystèmes côtiers au changement global», deux des équipes du LEMAR.
Avant même d’avoir suffisamment de moyens financiers pour mener à terme ce sujet, nous avons commencé à cartographier les aires de répartition de cette espèce en Bretagne. Ce travail m’a ensuite permis de choisir à partir de données empiriques (cartes satellitaires et données de températures de l’eau de 1990 à 2003), des populations d’huîtres dans trois sites répartis géographiquement en région nord-, ouest- et sud-Bretagne. Durant la première année, un échantillonnage massif a eu lieu sur ces trois populations, après avoir au préalable déterminé un plan d’échantillonnage le plus complet possible nous permettant par la suite de répondre aux questions posées. Ce plan d’échantillonnage avait longuement été discuté au sein de l’équipe mais aussi au niveau du laboratoire car il demandait l’aide de trois techniciens et d’une voiture de fonction. Dès la deuxième année ce sujet était financé ; il s’inscrit aujourd’hui dans le cadre d’un programme national coordonné par Christian Hily. Ce sujet constitue un thème transversal entre plusieurs équipes du laboratoire LEMAR, puisqu’il associe des écologistes mais aussi des physiologistes et des généticiens. Les différentes expérimentations ont été effectuées durant la 2 et 3ème année à partir du plan défini en concertation avec ma directrice de thèse, Marie-Thérèse Thébault. Ce sujet a demandé un accès à de nombreux outils de biologie moléculaire, dont des plateformes de génotypage haut-débit, et de physiologie, mais aussi à une main-d’œuvre conséquente constituée de 6 stagiaires, 3 techniciens, 1 professeur et moi-même.

II. Déroulement de la thèse

1. Préparation, financements

Dès la première année, un soin attentif a été mis en œuvre afin de déterminer le plan d’échantillonnage décisif pour le bon déroulement de ce travail de thèse. Bien qu’aucun moyen particulier ne soit alloué à ce sujet, des fonds provenant du Bureau des Ressources Génétiques, mandaté par les pouvoirs publics pour organiser, au plan national, la concertation dans le domaine des ressources génétiques et harmoniser les actions, a permis de finaliser la première étape du projet. A partir de la deuxième année, le sujet était entièrement financé par le programme PROGIG.

2. Collaborations

Le choix des collaborations a été établi après concertation avec l’ensemble des acteurs impliqués dans le programme et suivant les demandes de compétences scientifiques exigées par le sujet. C’est dans ce cadre, qu’une collaboration a été établie avec Pierre Boudry (Laboratoire de Génétique et de pathologies, Ifremer, La Tremblade) afin de mieux répondre à l’une des questions du travail de génétique. Pour répondre à cette question, les méthodes requises n’étaient pas utilisées dans notre laboratoire, et m’ont été transmises lors d’un stage d’un mois dans son laboratoire. Une autre partie des données nécessaires nous ont été transmises grâce à l’implication de l’équipe dans le réseau Rex Marine Genomics Europe, permettant des collaborations entre différentes équipes européennes. De plus, une collaboration plus étroite interne au Laboratoire, s’est installée avec Morgane Lejart, doctorante à partir de 2005 sous la direction de Christian Hily qui étudie, entre autre, les effets de l’huître sur les écosystèmes. Cette collaboration a permis de caractériser cette espèce comme étant invasive. Cette collaboration nous permet de réunir un maximum d’informations que ce soit écologique, biologique, physiologique et génétique, sur des populations communes. De plus, pour une partie de l’étude, j’ai du mettre en place sur des sites des sondes thermiques ainsi que des jeunes recrues en poche. Cette partie a été possible grâce à l’aide des ostréiculteurs avec qui j’ai pu travailler : Catherine Le Pottier (Ploubazlanec), Jean-Luc Le Gall (Plougastel-Daoulas) et Sébastien Lemoine (Carnac). Cette dernière partie a aussi demandé la mise en place d’une collaboration avec des biologistes modélisateurs de l’Ifremer : Yves Bourles et Stéphane Pouvreau (Ifremer, La Rochelle et Brest).

3. Conduite du projet de thèse

Lors de la première année, une dizaine de réunions ont eu lieu afin d’établir le meilleur plan d’échantillonnage et le planning correspondant avec les personnes impliquées dans le thème « Biologie des interactions et des adaptations ». Ces réunions étaient étalées sur une durée de 2 mois.. Enfin, une présentation du plan de travail a été présentée à l’ensemble du laboratoire afin de le valider. Chaque année, une présentation de l’avancement des travaux et de la planification des travaux à venir a été faite au laboratoire durant les Journées des Doctorants du LEMAR. Un bilan des travaux a également été effectué chaque année avec mon comité de thèse constitué de Chritian Hily (chercheur CNR, LEMAR), Dario Moraga (Maître de Conférence, Université de Bretagne Occidentale UBO), Lilianne Nonnotte (Professeur, UBO) et Didier Jollivet (chargé de Recherches au CNRS, Roscoff). Lors de ses réunions, nous discutions des avancées et des zones d’ombres de mon sujet qui devaient être prises en compte. Je me suis toujours exprimée et je considère avoir mené ce projet du début à la fin après concertation avec ma directrice de thèse.
Au vue des difficultés rencontrées à la fin de la deuxième année, une réorientation a été envisagée par ma directrice, mais après discussion et après avoir défendu mon opinion avec différents points à l’appui, nous avons décidé de continuer dans la voie que nous avions tracée dès la première année, et n’avons pas baissé les bras devant les difficultés. Au niveau pratique, j’ai eu le plaisir de travailler avec plusieurs techniciens qui m’ont eux aussi beaucoup appris. J’ai gardé de très bonnes relations avec la majorité des personnes que j’ai côtoyées pendant ma thèse.

3. Evaluation et prise en charge du coût du projet

Le nombre d’acteurs impliqués dans le projet est assez conséquent car il regroupe au total 17 personnes. Certaines ont été très sollicitées alors que d’autres n’ont apporté leur aide que ponctuellement. Quasiment tous les niveaux hiérarchiques présents dans un laboratoire sont représentés. Le coût en personnel du projet s’élève à 162 856 € avec 63 % de cette somme correspondant en fait à mon salaire et mes charges. Les moyens en personnel ont donc nécessité une forte demande de fonds.

....fin de l'extrait
leila Document NCT Mon, 18 Jun 2007 07:23:44 GMT http://www.ekera.fr/articles/view.php/610#comments 1 http://www.ekera.fr/comments/post.php/article/610 http://www.ekera.fr/comments/feed.php/article/610 http://www.ekera.fr/links/trackback.php?anchor=article:610